Un niño llamado Yugi Muto derrota al campeón mundial, Seto Kaiba, en un duelo con la ayuda del misterioso Millenium Puzzle, el apoyo de los amigos y el corazón de las cartas. Yugi se hace famoso en todo el mundo. Yugi y su amigo Joey participan en duelos para ayudar a salvar miembros de la familia. Todo el camino Yugi y el espíritu dentro del rompecabezas intentan entenderse más. Seto Kaiba intenta recuperar el título que una vez tuvo. Muchos personajes entran y salen, muchos son duelistas y es algunas batallas interesantes.