Han pasado tres años desde la infame masacre de Battle Royale, y uno de los niños que sobrevivió al sangriento juego, Shuya Nanahara, ha establecido un grupo terrorista, declarando la guerra a los adultos de Japón. El gobierno establece un nuevo juego, y los 42 niños escolares seleccionados al azar tienen esta vez la tarea de asaltar la fortaleza de la isla de los terroristas para matar a Nanahara en tres días, o ellos mismos serán terminados.